Det er FOA, der forhandler løn- og ansættelsesvilkår for den enkelte fleksjobber. Fleksjobbere er i øvrigt, udover løn og arbejdstid, ansat på samme overenskomstmæssige vilkår som øvrige kolleger. Derfor giver det også mening, at man er medlem af FOA, når man er fleksjobber.
FOAs tillidsvalgte kan være med til at organisere arbejdet på bedst mulige måde, så der både tages hensyn til fleksjobberen og de øvrige kolleger, og så alle parter sikres det bedst mulige arbejdsmiljø.
Fleksjobbere skal kun betale fagligt kontingent, fordi ansatte i fleksjob ikke er berettiget til dagpenge og efterløn.