Hovedbestyrelsen (HB) er den øverste myndighed mellem repræsentantskabsmøderne. Der er dog emner, som fagområdebestyrelserne bestemmer over.
Hovedbestyrelsen har 26 medlemmer. 11 vælges direkte på Repræsentantskabsmødet, heraf de fem medlemmer af forretningsudvalget. Almenområdet har seks repræsentanter, mens Specialområdet og Dagplejeområdet hver især har tre. Dertil kommer en repræsentant fra hver af de tre ledersektioner.
Hovedbestyrelsen mødes en gang om måneden i LFS, hvor der både træffes beslutninger om den fagpolitiske linje samt om fagforeningens daglige drift.
LFS organiserer mange forskellige faggrupper af varierende størrelser, lige som både udannede, ikke-uddannede og ledere er medlemmer. Grundtanken bag LFS' organisation er, at alle skal have en stemme i de styrende organer.
Observatører: